Az első generációs bioüzemanyagokkal kapcsolatosan külföldön és itthon is egyre gyakrabban és meggyőzőbben vetődnek fel komoly aggályok. Az eddig is egyértelmű volt, hogy gazdaságosságuk jóval elmarad a hagyományos üzemanyagokétól, és csak jelentős támogatással piacképesek. Egyidejűleg azonban láthatóvá váltak azok a közvetlen és közvetett hatások is, amelyek megkérdőjelezik, hogy hosszabb távon alternatívaként kezeljük.